Comentarios para FreeCFire - Leading drug development ;) http://freecfire.wordpress.com Blog del proyecto para II Concurso de Software Libre Wed, 30 Jan 2008 23:21:14 +0000 http://wordpress.com/ hourly 1 Comentario de juaxix en Fingerprints http://freecfire.wordpress.com/2007/11/28/fingerprints/#comment-8 juaxix Wed, 30 Jan 2008 23:21:14 +0000 http://freecfire.wordpress.com/2007/11/28/fingerprints/#comment-8 si, en la universidad aprendemos esas estructuras de datos, tablas hash y demás teoría de grafos :P comprendo lo q tienes q hacer con el problema, solo que no tengo una idea muy clara d lo q es "screening" o "fingerprints" :O bueno,ya sabes como son los algoritmos,...de repente alguien se da cuenta q un código del año 80 ahora es cojonudo porque sus constantes ocultas se ajustan a la perfección con un modelo de cálculo computacional actual xD Hombre...pasaba por aqui xD si, en la universidad aprendemos esas estructuras de datos, tablas hash y demás teoría de grafos :P comprendo lo q tienes q hacer con el problema, solo que no tengo una idea muy clara d lo q es “screening” o “fingerprints” :O
bueno,ya sabes como son los algoritmos,…de repente alguien se da cuenta q un código del año 80 ahora es cojonudo porque sus constantes ocultas se ajustan a la perfección con un modelo de cálculo computacional actual xD

Hombre…pasaba por aqui xD

]]> Comentario de formulacionmagistral en Fingerprints http://freecfire.wordpress.com/2007/11/28/fingerprints/#comment-7 formulacionmagistral Wed, 30 Jan 2008 19:15:42 +0000 http://freecfire.wordpress.com/2007/11/28/fingerprints/#comment-7 Es bastante habitual lo de los grafos lo que pasa es que esto es mas rapido para screening inicial de las moleculas esto de los fingerprints (si me puedo quitar moleculas demasiado complejas o simples, cuanto antes mejor). Luego, con los posibles candidatos ya reducidos, se usa algoritmos que sean algo mas lentos pero mas precisos. Ademas los fingerprints los puedes precalcular a modo de hash (palabra correcta?) y luego compararlos con todas las moleculas que te apetezca en tiempo minimo. Aunque esto es lo que he leido en los papers que son de hace un tiempo (5-6 años en esto es una barbaridad). Supongo que ahora mismo con todos los cores que tienen los micros se podrian usar tecnicas mas precisas aun a costa de un par de horas mas de proceso.....pero yo y el laboratorio solo tenemos unos P4 con sus 256Mb de RAM asi que.... Hey, gracias por tu interes, que tengo esto muy muerto! Es bastante habitual lo de los grafos lo que pasa es que esto es mas rapido para screening inicial de las moleculas esto de los fingerprints (si me puedo quitar moleculas demasiado complejas o simples, cuanto antes mejor). Luego, con los posibles candidatos ya reducidos, se usa algoritmos que sean algo mas lentos pero mas precisos.

Ademas los fingerprints los puedes precalcular a modo de hash (palabra correcta?) y luego compararlos con todas las moleculas que te apetezca en tiempo minimo.

Aunque esto es lo que he leido en los papers que son de hace un tiempo (5-6 años en esto es una barbaridad). Supongo que ahora mismo con todos los cores que tienen los micros se podrian usar tecnicas mas precisas aun a costa de un par de horas mas de proceso…..pero yo y el laboratorio solo tenemos unos P4 con sus 256Mb de RAM asi que….

Hey, gracias por tu interes, que tengo esto muy muerto!

]]> Comentario de juaxix en Fingerprints http://freecfire.wordpress.com/2007/11/28/fingerprints/#comment-6 juaxix Wed, 30 Jan 2008 00:49:40 +0000 http://freecfire.wordpress.com/2007/11/28/fingerprints/#comment-6 supongo que se usa algún tipo de algoritmo potente para comprobar que dos moléculas se parecen...alguna q tenga q ver con grafos? supongo que se usa algún tipo de algoritmo potente para comprobar que dos moléculas se parecen…alguna q tenga q ver con grafos?

]]> Comentario de formulacionmagistral en Presentación http://freecfire.wordpress.com/2007/11/16/presentacion/#comment-5 formulacionmagistral Fri, 16 Nov 2007 18:07:23 +0000 http://freecfire.wordpress.com/2007/11/16/presentacion/#comment-5 Hola, Contestaros un poco a las cuestiones que me habeis contestado: 3. Gracias por la ayuda, de verdad, a lo mejor la necesito porque aunque llevo un tiempo programando en C (unos añillos) no soy todo lo bueno que quisiera....ejem. Lo de la AI mas bien no. Tiene bastante mas de quimica que otra cosa (enlaces, funciones, estereoquimica, etc...) y los algoritmos que tengo pensados son mas bien facilones pero muy muy eficientes para busquedas masivas. Ya ire poniendo en algun lado mi base teorica por si alguien mas le interesa aprender algo de "cheminformatics". 1. Respecto a C++, internet esta llena foros dondes se discute C puro vs resto del mundo. Es cuestion de preferencia personal, yo, simplemente, no me sale programar en C++, para objetos ya tengo Java...pero es muy personal. Hola,

Contestaros un poco a las cuestiones que me habeis contestado:

3. Gracias por la ayuda, de verdad, a lo mejor la necesito porque aunque llevo un tiempo programando en C (unos añillos) no soy todo lo bueno que quisiera….ejem.

Lo de la AI mas bien no. Tiene bastante mas de quimica que otra cosa (enlaces, funciones, estereoquimica, etc…) y los algoritmos que tengo pensados son mas bien facilones pero muy muy eficientes para busquedas masivas. Ya ire poniendo en algun lado mi base teorica por si alguien mas le interesa aprender algo de “cheminformatics”.

1. Respecto a C++, internet esta llena foros dondes se discute C puro vs resto del mundo. Es cuestion de preferencia personal, yo, simplemente, no me sale programar en C++, para objetos ya tengo Java…pero es muy personal.

]]> Comentario de juaxix en Presentación http://freecfire.wordpress.com/2007/11/16/presentacion/#comment-4 juaxix Fri, 16 Nov 2007 00:54:42 +0000 http://freecfire.wordpress.com/2007/11/16/presentacion/#comment-4 Hola,ésto parece más inteligencia artificial,o no? mucha suerte con tu proyecto, no dudes en preguntarnos a los informáticos dudas de programación en C ,solemos dar en dicho lenguaje varias asignaturas de los primeros cursos de la carrera XDD aunque algun@s no quieran jaja y además tenemos otras asignaturas como Modelos de la Inteligencia Artificial o IA a secas... ¡Ánimo con esos organismos virtuales! Saludos. Hola,ésto parece más inteligencia artificial,o no? mucha suerte con tu proyecto, no dudes en preguntarnos a los informáticos dudas de programación en C ,solemos dar en dicho lenguaje varias asignaturas de los primeros cursos de la carrera XDD aunque algun@s no quieran jaja y además tenemos otras asignaturas como Modelos de la Inteligencia Artificial o IA a secas…
¡Ánimo con esos organismos virtuales!
Saludos.

]]> Comentario de jpboli en Presentación http://freecfire.wordpress.com/2007/11/16/presentacion/#comment-3 jpboli Fri, 16 Nov 2007 00:34:47 +0000 http://freecfire.wordpress.com/2007/11/16/presentacion/#comment-3 Por lo demás, ¡no quiero ser negativo! El proyecto es una gran idea y espero que salga adelante, desde luego, es mucho más útil para la humanidad que el mío :) ¡Ánimo! Por lo demás, ¡no quiero ser negativo! El proyecto es una gran idea y espero que salga adelante, desde luego, es mucho más útil para la humanidad que el mío :)

¡Ánimo!

]]> Comentario de jpboli en Presentación http://freecfire.wordpress.com/2007/11/16/presentacion/#comment-2 jpboli Fri, 16 Nov 2007 00:33:43 +0000 http://freecfire.wordpress.com/2007/11/16/presentacion/#comment-2 Una pequeña duda... ¿qué tiene de malo C++ desde el punto de vista de la eficiencia? Una pequeña duda… ¿qué tiene de malo C++ desde el punto de vista de la eficiencia?

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