FreeCFire – Leading drug development ;)

Pfff…como empiezo. Hace la tira de tiempo que no escribo nada. Bueno, pues lo primero es que se acabo la beca Erasmus (todo tiene su final) pero por lo menos también se han acabado los exámenes con lo que ya me he puesto otra vez a currar en el proyecto.

He subido al Subversion lo más nuevo que tengo. A saber:

- Las librerias libmol y libsdf para leer ficheros de intercambio de bases de datos de moléculas.
- El programa fingerbase que de momento prueba las librerías y permite hacer búsquedas en bases de datos pequeñas.
- Rudimentario sistema de plugins. Le falta bastante.

Esta algo pobre de documentación pero cuando controle por fin el doxygen y lo integre con lo que tengo de automake-autoconf mejorará algo.

Sin subir también tengo algo para utilizar SQLite3 en el almacenamiento de los fingerprints calculados. A modo de indice molecular o algo por el estilo.

Aunque he completado algo la implementación del fingerprint que diseñe con los enlaces entre 3 átomos y parte de un detector molecular de quinolonas, aún me falta el detector de anillos sin el cual no se puede detectar la mayor parte de moléculas ni finalizar el fingerprint.
He visto con las pruebas que he realizado (se pueden descargar de la sección de documentos de la forja por cierto) que se obtienen resultados muy prometedores con base de datos de sintéticos (tanto en antivirales tipo aciclovir como en antibacterianos tipo fluoroquinolonas) pero ya tengo unas 6Gb de moléculas naturales de varios fabricantes así que cuando arregle el fantasma de lack que hace que no pueda pasar de las 3000 moléculas podré probarlo a lo grande

Bueno, creo que eso es todo…ahh y por supuesto la foto, que, como no tengo nuevas de Londres (que se puedan poner en la web ) la sustituyo por…..un diagrama de aplicación!!!