No soy tan vago 28 Noviembre 2007
Posted by formulacionmagistral in Concurso.trackback
Bueno, a lo mejor si lo soy, pero tengo muchas cosas que hacer (y visitar) y sobre todo tengo que echarle muchas horas para terminar mi investigación de los aceites esenciales asi que de momento no es mi principal objetivo. (ya le dare caña después)
Aqui va un resumen de lo que he hecho hasta ahora, la documentación que he escrito y algunas cosas muy interesantes que me he encontrado para entender mejor el estado actual de la búsqueda de compuestos asistida por ordenador ya los colgare en la forja (cuando la tenga puesta jeje):
1. He terminado la fase de documentación sobre las soluciones que estan disponibles y el estado actual de esta ciencia (gracias Google Scholar y sobre todo que haría sin ti Scirus!)
2. He escrito parte de la librería para manipular ficheros SD tanto planos como comprimidos (vaya con el API de zlib, no me lo conocia yo…q potencia!
).
3. He escrito parte de la librería para manipular el formato molecular MOL y parte de mi implementación inicial de fingerprints.
4. He hecho algunas pruebas para ver si mi fingerprint (preliminar, solo con átomos, enlaces y peso molecular) funcionaba decentemente y parece que funciona muy bien los resultados demuestran un funcionamiento particularmente acertado. (Entre 4009 moléculas del ChemBank encontró unos 15 parecidos en más de un 90% al aciclovir y TODOS eran “(*)antivirales de bases de palo”(TM)(C) como el aciclovir…juas).
5. Estoy ahora con el detector de anillos (uno muy muy simple) y luego comenzaré con el detector molcular. En principio planeo implementar los más significativos (derivado de ciclopentanoperhidrofenantreno, azucares, aminoácidos, alcaloides, varios terpenos) y luego ampliaré la definición del fingerprint.
6. Tengo muchos documentos pero no se si puedo publicarlos porque son de revistas científicas asi que estarán muy restringidos de todas formas algo de trapicheo se podra hacer…
Y nada más ya ire poniendo cosas en la forja, asi que el que le interese pues que mire algo…
Saludos desde Oxford….pero que cultiBado me estoy volviendo.
(*). Me refiero a antivirales de base nitrogenada con azucar roto o sucedaneo: ganciclovir, aciclovir, etc…
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